研究报告

SYBR Green II黄芩18S rRNA基因实时荧光定量PCR方法的建立  

王帅 , 程林 , 杨利民* , 韩梅
吉林农业大学中药材学院, 长春, 130118
作者    通讯作者
《分子植物育种》印刷版, 2019 年, 第 17 卷, 第 29 篇   
收稿日期: 2018年05月04日    接受日期: 2018年06月12日    发表日期: 2019年05月22日
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摘要

利用 SYBR Green染料法,建立黄芩实时荧光定量 PCR 的反应体系。根据 18S rRNA 基因序列保守性,在 18S rRNA 基因保守区设计一对特异性引物,以常规 PCR 产物为标准品,浓度梯度稀释后制定标准曲线,对溶解曲线进行分析,对 PCR 退火温度,引物浓度,模板浓度等反应条件进行优化。结果表明:在 20 L反应体系中,加入 10 L SYBR Premix Ex TaqTM 时,引物和 cDNA 最佳加入量分别为 0.8 L 1.0 L;最佳反应程序:进行 40 次循环,95预变性 30 s95变性 5 s55退火 30 s72延伸 30 s。标准曲线 Ct 的检测范围在 14~29,扩增效率为 97.8%;溶解曲线显示为单峰,其 Tm (851.0)。本研究建立的黄芩 18S rRNA基因实时荧光定量 PCR 法,具有检测范围广,扩增效率高,特异性高等优点,对从分子水平阐明黄芩药效成分合成机制,筛选高产优质的黄芩种质资源具有重要的意义。
 

关键词
黄芩;内参基因;实时荧光定量 PCR;SYBR Green Ⅱ

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