盛文涛 , 邓建兰 , 饶友生 , 柴学文 , 刘建坤

南昌师范学院,生物技术研究所,南昌, 330032
作者    通讯作者
《分子植物育种》印刷版, 2019 年, 第 17 卷, 第 21 篇   
收稿日期: 2018年05月14日    接受日期: 2018年06月15日    发表日期: 2019年08月04日

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为了明确芦笋 EST序列中 SSR 的总体分布特点，开发芦笋 EST-SSR 标记，为利用 EST-SSR 分子标记进行芦笋遗传研究提供了理论依据。本研究从 NCBI 数据库上获得了 8 615 条 EST，并利用在线软件ssrtool和 websat检测所含 SSR位点序列，并进行分析。共检索出 483条SSR序列，检出率为 5.61%。其中二核苷酸重复基元的EST-SSR占主导地位，占总 SSR数目的 32.3%。利用在线引物设计软件 Primer3.0开发了424对 EST-SSR 引物，随机挑选 50 对引物， 以 4 份芦笋品种种质资源的 DNA为模板， 经 8%非变性聚丙烯酰胺凝胶电泳，通过筛选验证获得了 42 对多态性引物，表明开发的 EST-SSR 具有较好的多态性。这些EST-SSR标记的开发不仅丰富了芦笋的分子标记数量，而且为其种质资源的遗传分析提供了理论依据。

芦笋(Asparagus officinalis)；NCBI；EST-SSR标记；多态性