研究报告

马铃薯TCP基因家族全基因组鉴定与分析  

肖熙鸥 , 林文秋 , 冯雪峰 , 高晓敏 , 邹华芬 , 李可 , 金辉*
中国热带农业科学院南亚热带作物研究所, 农业部热带果树生物学重点实验室, 湛江, 524091
作者    通讯作者
《分子植物育种》印刷版, 2018 年, 第 16 卷, 第 3 篇   
收稿日期: 2018年05月10日    接受日期: 2018年05月31日    发表日期: 2019年01月16日
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摘要

TCP (Teosinte branched1/Cincinnata/proliferating cell factor)是植物特有的转录因子,在植物的生长发育过程中发挥着重要的作用。马铃薯(Solanum tuberosum L.)是世界范围重要的粮食作物,有着重要的价值。为研究马铃薯 StTCPs 基因家族子在马铃薯基因组中的数量与分布,本研究利用生物信息学方法,对马铃薯 StTCPs 家族成员进行全基因组鉴定,并且对其基因结构,染色体定位以及进化关系进行预测和分析。研究结果表明,马铃薯 StTCPs 家族共包含 43 个成员,可以分为 ClassClass两类。染色体定位结果表明,马铃薯 StTCPs 不均匀地分布于 11 条染色体上,其中 3 号染色体分布的成员最多,包含 10 个家族成员。蛋白结构分析表明,StTCPs 包含一个 b-HLH 结构域。本研究系统的分析了马铃薯 StTCPs 基因家族成员,为其后续功能的研究提供了良好的基础。

关键词
马铃薯(Solanum tuberosum);TCP 转录因子;全基因组检索

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《分子植物育种》印刷版
• 第 16 卷
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