韩彦卿^1,2 , 王鹤³ , 刘锐¹ , 武彩娟¹ , 王慧娜¹ , 张宝俊¹ , 韩渊怀^1,2*

1 山西农业大学农学院, 太谷, 030801; 2 山西农业大学农业生物工程研究所, 太谷, 030801; 3 山西农业大学新农村发展研究院, 太谷, 030801
作者    通讯作者
《分子植物育种》印刷版, 2018 年, 第 16 卷, 第 1 篇   
收稿日期: 2018年04月28日    接受日期: 2018年05月28日    发表日期: 2018年08月16日

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推荐引用：

Han Y.Q., Wang H., Liu R., Wu C.J., Wang H.N., Zhang B.J., and Han Y.H., 2018, Bioinformatics and expression analysis
of MYB transcription factors response to Sclerospora graminicola infection in foxtail millet, Fenzi Zhiwu Yuzhong (Molecular Plant Breeding), 16(15): 4817-4823 (韩彦卿, 王鹤, 刘锐, 武彩娟, 王慧娜, 张宝俊, 韩渊怀, 2018, 谷子 MYB 转录因子响应 Sclerospora graminicola 侵染的生物信息学及表达分析, 分子植物育种, 16(15): 4817-4823)

谷子白发病可严重降低谷子的产量和品质，谷子 MYB 转录因子在调控生物胁迫响应中扮演重要的角色。本研究依据课题组前期白发病菌侵染谷子不同时期的相关转录组数据，获得 6 个显著差异表达的MYB 转录因子，结合 ExPASY、GSDS、Phytozome、Prot Comp 9.0 和 MEGA7.0 等软件对其启动子元件、亚细胞定位及系统进化等分析。随后，利用 qRT-PCR 方法对该 6 个转录因子的表达模式进行验证。结果表明，通过比较分析 6 个显著差异表达的 MYB 转录家族与玉米、水稻、拟南芥 MYB 家族共同构建的进化树，发现谷子 MYB 基因家族与玉米、水稻等禾本科聚为一类，与拟南芥亲缘关系较远；亚细胞定位预测结果示，4个 MYB 转录因子定位于细胞质中，其余 2 个主要定位于胞外。顺式作用元件分析，发现谷子 6 个MYB 转录因子中均含有响应防御胁迫和真菌激发响应、MeJA、脱落酸和水杨酸等作用元件。最后，基于荧光定量PCR 的差异表达数据进一步验证了 MYB 转录因子在抗病过程中发挥重要转录调控作用。该研究结果可为今后 MYB 基因的克隆、功能验证以及开展抗病分子育种提供理论依据。

谷子； 白发病菌； MYB 转录因子； 转录组测序； 表达模式