研究报告/Research Report

红麻干旱响应基因 EST-SSR 标记  

金关荣1 , 安霞 1* , 骆霞虹1 , 陈常理1 , 李文略1 , 李苹芳1 , 田丹青1 , 王斌2 , 吴文嫱3 , 朱关林1
1 浙江省萧山棉麻研究所, 浙江省农业科学院花卉研究开发中心, 杭州, 311202; 2 中国热带农业科学院, 海口, 571101; 3 海南大学, 海口, 570228
作者    通讯作者
《分子植物育种》印刷版, 2018 年, 第 16 卷, 第 31 篇   
收稿日期: 2018年04月28日    接受日期: 2018年05月13日    发表日期: 2018年08月08日
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摘要

本研究以前期高通量测序结果为基础,利用 MISA 软件分析了所获得的转录组数据的 SSR 位点,发掘了 11 EST-SSR 标记。这 11 EST-SSR 标记了红麻响应干旱胁迫的关键基因外显子区的简单重复序列多态性,并且在遗传变异来源广泛的红麻品种中具有多态性,可以区分 44 个红麻品种。通过 5 个红麻品种的初步筛选和 44 个红麻品种的验证,这 11 个多态性标记可稳定检测,可以直接将本研究所开发的标记应用于更多红麻品种的检测,进行种质资源分子遗传多样性评价、亲缘关系鉴定和关键抗旱基因的特定外显子区简单重复序列多态性分析,为红麻分子标记辅助育种提供良好的标记储备,也为红麻自然变异中筛选关键基因的功能等位变异提供一种检测的候选分子标记。

关键词
红麻;干旱;基因;分子标记

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《分子植物育种》印刷版
• 第 16 卷
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