研究报告

杨树 10 种 miRNA 的低氮胁迫差异表达及靶基因的鉴定与分析  

包海 , 孙丰硕 , 徐千惠 , 王延伟* ,
北京林业大学, 林木育种国家工程实验室, 林木花卉遗传育种教育部重点实验室, 国家林业局树木花卉育种与生物工程重点开放实验室, 北京, 100083
作者    通讯作者
《分子植物育种》印刷版, 2019 年, 第 17 卷, 第 11 篇   
收稿日期: 2018年04月28日    接受日期: 2018年05月13日    发表日期: 2019年02月28日
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摘要

microRNA (miRNA)是一类重要的非编码小分子 RNA,在植物应对逆境胁迫的响应中起着重要调控作用。为了探讨 miRNA 在杨树受低氮营养胁迫不同时间段的差异表达模式以初步鉴定参与低氮胁迫响应的 miRNA,本研究以重要乡土树种毛白杨为材料,进行不同时间段的低氮胁迫处理,分别提取长度在 200 nt以下的小片段 RNA,利用实时定量 PCR 技术研究毛白杨在低氮胁迫后 10 miRNA 的差异表达模式。结果显示,miRNA 的表达在低氮胁迫下有显著变化,部分 miRNA 的表达呈现动态反应。在低氮胁迫下,miRNA的表达呈现四种模式,大部分 miRNA 的表达在处理 1 d 后受到显著抑制。借助生物信息学手段,进一步鉴定到10 miRNA 的靶基因,功能注释表明靶基因共分为 6 大类,降解组实验进一步验证了 miR159a 对靶基因的切割。该研究初步表明,miRNA 在杨树对低氮营养的胁迫响应中可能发挥着重要调控作用。

关键词
毛白杨;低氮营养胁迫;microRNA;靶基因;差异表达

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《分子植物育种》印刷版
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