杨玲玲^1,2* , 王磊^1,2* , 赵德刚^1,2,4** , 赵懿琛^1,2,3**

1 贵州大学生命科学学院, 农业生物工程研究院, 贵州省农业生物工程重点实验室, 山地植物资源保护与种质创新省部共建教育部重点实验室,贵阳, 550025; 2 贵州省山地生态与农业生物工程 2011 协同创新中心, 贵阳, 550025; 3 贵州大学茶学院, 贵阳, 550025; 4 贵州省农业科学院, 贵阳, 550006
作者    通讯作者
《分子植物育种》印刷版, 2018 年, 第 16 卷, 第 15 篇   
收稿日期: 2018年04月13日    接受日期: 2018年04月30日    发表日期: 2019年01月22日

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本研究在课题组已构建的杜仲基因组数据库注释的信息基础上设计特异性引物，利用同源克隆的方法从杜仲转录本中克隆得到一个基因的全长编码序列(CDS)，将该基因命名为 EuDREB1。序列分析结果表明 EuDREB1 基因的 CDS 序列全长为 255 bp，共编码 84 个氨基酸，包含 1 个 AP2 结构域，且该结构域的第 14 位氨基酸为缬氨酸(V)，符合 DREB 类转录因子的蛋白序列特征，推断 EuDREB1 基因属于该类转录因子基因。分析可知，转录因子 EuDREB1 为不稳定的亲水性蛋白，相对分子质量为 9.41 kD，理论等电点 pI 为5.66，含有磷酸化位点但不具有信号肽及跨膜结构；其二级结构中含有 4 个 α- 螺旋、1 个β- 折叠及 6 个无规卷曲；其三级结构以α 螺旋及β 折叠为主，符合 AP2 结构域的模型特征。本研究通过克隆 EuDREB1 基因并进行相应的生物信息学分析，为进一步探明杜仲 DREB 转录因子相关基因的功能提供了一定的实验基础。
 

杜仲；EREBP 基因家族；EuERDB1；基因克隆；生物信息学分析