研究报告

基于 Illumina HiSeq 2500 测序技术对高温胁迫下苦瓜叶片转录组特性 分析  

杜文丽1 , 陈中钐1 , 许端祥 1 , 高山1 , 温庆放2
1 福州市蔬菜科学研究所, 福州, 350111; 2 福建省农业科学院作物所, 福州, 350013
作者    通讯作者
《分子植物育种》印刷版, 2019 年, 第 17 卷, 第 5 篇   
收稿日期: 2018年04月09日    接受日期: 2018年05月07日    发表日期: 2019年02月20日
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摘要

高温胁迫时影响苦瓜作物产量及地域分布的重要限制因子,但由于其在非生物胁迫逆境方面的生物学信息研究进展较慢,这在一定程度上制约了苦瓜分子育种及品种改良工作。利用 Illumina HiSeqTM 2500高通量测序平台对高温胁迫处理前后的苦瓜叶片进行转录组测序,结果组装获得平均长度为 700.75 bp 89 757 条有效 UnigeneN50 长度达到 1 239 bp;有 48 662 Unigene 获得注释信息,占全部 Unigene 54.2%,与未处理的对照相比,共有 2 254 差异表达基因,其中 672 个上调,1 582 下调表达。有 27 116 Unigene 能够注释到 GO 数据库,获得包含于细胞组分、分子功能和生物学过程三大类内共 135 967 GO的功能注释,并且差异表达基因的 GO 功能注释分类情况大致与之相似。进一步筛选到可能与高温胁迫相关的基因,包括 HSPHSF 等家族基因。本研究是首次对高温胁迫下的苦瓜叶片转录组进行分析,为进一步开展苦瓜耐高温分子生物学层面研究提供大量参考信息。

关键词
苦瓜;高温胁迫;Illumina HiSeq 2500 测序;差异表达基因

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《分子植物育种》印刷版
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