研究报告

红毛丹SSR-PCR反应体系优化及多态性标记筛选  

林兴娥1 , 牛俊海2 , 陈莹3 , 马蔚红1 , 臧小平1 , 葛宇1 , 王甲水1 , 周兆禧1*
1 中国热带农业科学院海口实验站, 海口, 570102; 2 中国热带农业科学院热带作物品种资源研究所, 儋州, 571737; 3 海南大学热带农林学院, 儋州, 571737
作者    通讯作者
《分子植物育种》印刷版, 2018 年, 第 16 卷, 第 28 篇   
收稿日期: 2018年03月21日    接受日期: 2018年03月29日    发表日期: 2019年01月24日
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摘要

为建立适宜红毛丹 SSR-PCR 反应的最佳体系并筛选出具有多态性的 SSR 引物,采用 L16(45)正交试验设计对反应体系中的各组分(模板 DNA, 引物, Mg2+, dNTPs 和 Taq DNA 聚合酶)进行了优化,建立了红毛丹 SSR-PCR 的最佳反应体系(20 μL):DNA 模板 30 ng、dNTPs 0.40 mmol/L、引物 0.4 μmol/L、Taq DNA 聚合酶 1.5 U、Mg2+ 1.50 mmol/L;利用优化后的 SSR-PCR 体系和 6 份红毛丹种质基因组 DNA 模板,从 50 对 SSR 引物中筛选出 11 对条带清晰、多态性丰富、重复性好的 SSR 引物,多态比例达 22%。本研究为后续红毛丹种质资源遗传多样性分析、分子指纹图谱构建和品种鉴定等研究提供了技术参考。
 

关键词
红毛丹;SSR;体系优化;引物筛选

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《分子植物育种》印刷版
• 第 16 卷
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