研究报告

杧果中DXR基因的鉴定及与其他果树的比较分析  

盖江涛 , 白蓓蓓 , 叶秀旭 , 王鹏 , 党志国 *
中国热带农业科学院热带作物品种资源研究所, 儋州, 571737
作者    通讯作者
《分子植物育种》印刷版, 2018 年, 第 16 卷, 第 8 篇   
收稿日期: 2018年03月15日    接受日期: 2018年03月28日    发表日期: 2019年01月23日
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摘要

1- 脱氧 -D- 核酮糖 5- 磷酸还原酶(1-deoxy-D-xylulose 5-phosphate reductoisomerase, DXR)是 2-C-甲基 -D- 赤藓糖醇 -4- 磷酸(2-C-Methyl-D-erythritol-4-phosphate, MEP)途径的一个关键酶。本研究以杧果DXR 基因作为研究目标,通过 BLASTP 方法获得了甜樱桃、白梨、西洋梨、苹果、桃子、枇杷、金钱橘、甜橙、葡萄、软枣猕猴桃、榴莲、枣、番木瓜、小果野蕉、凤梨的 DXR 基因的蛋白序列,共 18 条序列,对其进行了保守结构域、保守基序、系统发育、理化性质、蛋白二级结构分析等研究。保守结构域及保守基序分析结果表明:杧果 DXR 蛋白包含一个 PLN02696 结构域,保守结构域内包含 5 个 motif,其宽度、排列顺序与其他 15 种果树均相同,说明 DXR 基因家族具有高度保守性。系统发育分析结果显示:单子叶植物纲与双子叶植物纲的DXR 基因分别形成了分支,推测在进化过程中DXR 基因的分化至少在双子叶植物纲和单子叶植物纲形成之前。理化性质分析及蛋白二级结构分析结果显示:所有蛋白均为酸性、无信号肽蛋白,稳定性蛋白占38.9%,亲水性蛋白占 44.4%,杧果 DXR 蛋白为稳定的亲水性蛋白;杧果 DXR 蛋白的二级结构主要结构元件是无规则卷曲、α- 螺旋。本研究为进一步研究杧果 DXR基因在萜类合成途径中的作用提供理论支持。

关键词
杧果;1- 脱氧 -D- 核酮糖 5- 磷酸还原酶(DXR);MEP;萜类

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《分子植物育种》印刷版
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