研究报告

滇重楼根茎数字基因表达谱研究  

徐永艳 1,2 , 徐荣 3 , 张春华1 , 孙永玉 1 , 熊辉 1 , 杨汉奇 1 , 李昆 1*
1 中国林科院资源昆虫所, 昆明, 650224; 2 西南林业大学园林学院, 昆明, 650224; 3 云南农业大学农学与生物技术学院, 昆明, 650201
作者    通讯作者
《分子植物育种》印刷版, 2019 年, 第 17 卷, 第 14 篇   
收稿日期: 1970年01月01日    接受日期: 1970年01月01日    发表日期: 2019年12月14日
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摘要

本研究利用高通量测序技术对滇重楼根茎 1 年生龄段(R1)3 年生龄段(R3)进行基因表达谱分析。结果表明:R3 相对于 R1,上调的差异基因 3 758 个,下调的差异基因 1 353 个;GO 数据库显著富集的差异基因涉及生物学过程、细胞成分及分子功能相关的共 53 种生理代谢功能;两组样品间差异表达基因涉及COG 分类的 25 个生物学功能类别,其中翻译、核糖体结构和生物合成功能的 Unigenes 数目最多;KEGG 注释表明 R1R3 的差异表达基因 Pathway 涉及到 5 个功能大类、50 个功能小类、2 016 条代谢通路。以上研究结果对研究滇重楼根茎生长发育过程中的分子机制具有一定的参考价值。

关键词
滇重楼;根茎;数字基因表达谱;差异基因

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《分子植物育种》印刷版
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