研究报告

花生 AhLRPK1 基因的克隆及生物信息学分析  

庄瑞蓉2 , 储文婷2 , 赵闪闪2 , 陈坤2 , 谢文萍2 , 王自帅2 , 赵国旗2 , 陈伟 1* , 张冲2*
1 福建农林大学生命科学学院, 福州, 350002; 2 闽台作物有害生物生态防控国家重点实验室, 福州, 350002
作者    通讯作者
《分子植物育种》印刷版, 2018 年, 第 16 卷, 第 3 篇   
收稿日期: 2018年03月07日    接受日期: 2018年04月28日    发表日期: 2018年06月21日
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摘要

植物受体蛋白激酶参与植物的生长发育,抗逆抗病防御反应、细胞分化、在宿主与病原菌互作过程中起着重要的作用。目前在花生上蛋白激酶基因研究较少。本研究基于前期多态性 SNP 标记的开发和 QTL定位,获得了一个抗青枯病候选蛋白激酶基因;通过 RT-PCR 克隆技术获得了一段长为 2 154 bp ORF 序列,暂命名为 AhLRPK1;采用生物信息学方法预测并分析 AhLRPK1 基因编码的蛋白质常规理化性质,跨膜结构域、进化分析和高级结构等。结果表明 AhLRPK1 基因编码 717 个氨基酸为稳定的亲水性蛋白,含有一个信号肽、跨膜结构域、多个 LRR 基序以及一个激酶结构域;与拟南芥 LRR 亚家族进化同源性分析显示AhLRPK1 属于 LRR亚家族,与拟南芥的 AT3G13065 蛋白亲缘关系最近;AhLRPK1 基因在花生基因芯片中表达模式分析表明,在茎和花中的表达量最大,在青枯菌诱导情况下,A hLRPK1 基因在抗感花生品种中都表现出下调表达的趋势,AhLRPK1 基因受乙烯利表达下调。这些结果有助于进一步验证其生物功能。

关键词
AhLRPK1;受体蛋白激酶;抗病防御; 生物信息预测;表达分析

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《分子植物育种》印刷版
• 第 16 卷
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