白杨¹ , 林晓飞² , 张文波^1*

1 内蒙古农业大学林学院, 呼和浩特, 010019; 2 内蒙古大学生命科学学院, 呼和浩特, 010021
作者    通讯作者
《分子植物育种》印刷版, 2018 年, 第 16 卷, 第 29 篇   
收稿日期: 2018年03月12日    接受日期: 2018年03月30日    发表日期: 2019年01月17日

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为深入分析杂交构树的遗传多样性，开发可靠的分子标记，采用同源克隆技术分离了 Ty3-gypsy 类逆转座子逆转录酶序列，并对其同源性及系统进化关系进行了分析。所分离的 40 条序列(命名为 BpRT1-40)长度为 410~420 bp，均富含 AT 碱基，序列间的同源性范围为 14.2%~99.3%，显示较高异质性。氨基酸序列分析发现，其中有 19 条序列发生了终止密码子突变、9 条发生了移框突变，表明终止密码子突变和移框突变可能是导致杂交构树逆转座子异质性的主要原因。系统进化分析显示：该 40 条氨基酸序列由 2 个基因家族组成，其中Family玉包含 38 条序列，由 5 个亚家族组成，各亚家族成员间亲源关系较近；Family域包含 2 条序列，它们与其它序列亲缘关系较远。与其他植物 Ty3-gypsy 类逆转座子逆转录酶进行系统进化分析发现，所克隆的序列与绿豆、荸荠、兴安落叶松、皱皮椒草、油棕、黄瓜、向日葵等植物的 Ty3-gypsy 类逆转座子逆转录酶序列具有较近的亲缘关系。以上结果说明：Family玉是杂交构树中广泛存在的逆转座子家族，它们可能在杂交构树的遗传进化中发挥着重要的作用。Family域中的 2 条序列同源性较低，同时与其它物种的 Ty3-gypsy 类逆转座子转
录酶的遗传距离也较远，由此可以说明 Family域的起源比较古老，特异性强。本研究为进一步合理地利用杂交构树资源提供理论基础。

杂交构树；逆转座子；逆转录酶；遗传多样性