研究报告

大豆GmGLDH基因的克隆、表达及生物信息学分析  

薛晨晨 , 徐筋燕 , 郭娜 , 赵晋铭 , 邢邯
南京农业大学农学院, 国家大豆改良中心, 农业部大豆生物学与遗传育种重点实验室, 作物遗传与种质创新国家重点实验室, 南京, 210095
作者    通讯作者
《分子植物育种》印刷版, 2019 年, 第 17 卷, 第 2 篇   
收稿日期: 2018年02月11日    接受日期: 2018年03月12日    发表日期: 2019年05月07日
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摘要

为了探究大豆 L- 半乳糖酸 -1,4- 内酯脱氢酶基因GmGLDHGlyma.02G166300 (以下简称GmGLDH)的功能,本研究采用同源克隆法获得大豆 GmGLDH 基因,开展了相关生物信息学分析,并对其非生物胁迫下表达模式进行调查。结果表明,GmGLDH 基因包含一个长度为 1 752 bp ORF 序列,编码 584 个氨基酸。GmGLDH 蛋白为亲水性较强的蛋白;二级结构中以无规则卷曲和 螺旋结构为主;预测亚细胞定位GmGLDH 主要分布在线粒体中,分析结果并未发现跨膜结构域和信号肽结构;该蛋白序列中存在磷酸化位点 56 个。进化分析表明,克隆的 GmGLDH 氨基酸序列与菜豆、苜蓿的同源关系较近。基因上游顺式调控元件分析表明该基因可能参与光应答、激素响应、高温响应等,但光处理下大豆子叶中 GmGLDH 基因的表达变化不大,且和子叶中抗坏血酸含量无相关性;4 种非生物胁迫处理下大豆叶片中 GmGLDH 基因是先下调后上调表达,和抗坏血酸含量变化呈反相关。本研究为进一步研究 GmGLDH 基因在大豆抗逆中的作用提供了重要的帮助。

关键词
大豆;L- 半乳糖酸 -1,4- 内酯脱氢酶基因;非生物胁迫;表达;生物信息学分析

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《分子植物育种》印刷版
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