研究报告

葱属蔬菜作物叶绿体 DNA提取及其质量评价体系的建立  

孙雨晴1,2 , 陈立2,3 , 杨亚会2,3 , 杨妍妍2 , 吴雄2 , 于占东1* , 霍雨猛2*
1吉林农业大学园艺学院, 长春, 130118; 2 山东省农业科学院蔬菜花卉研究所, 山东省设施蔬菜生物学重点实验室, 国家蔬菜改良中心山东分中心,济南, 250100; 3 山东农业大学园艺科学与工程学院, 泰安, 271018
作者    通讯作者
《分子植物育种》印刷版, 2018 年, 第 16 卷, 第 35 篇   
收稿日期: 2018年01月26日    接受日期: 2018年02月28日    发表日期: 2019年01月17日
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摘要

为了探究不同提取方法对葱属蔬菜作物叶绿体 DNA提取效果的影响,首先以大葱叶片为实验材料,采用高盐低pH值法和蔗糖 DNase法,对其进行叶绿体 DNA提取测试。结果表明, 高盐低 pH法优于蔗糖DNase法,其 DNA纯度相似, A260/A280 值分别 1.984和 1.977;产率差异大,分别为 0.482 滋g/g FW(fresh weight, FW)和0.059 滋g/g FW,高盐低pH值法是蔗糖DNase法产率的8.17倍。随后,利用叶绿体MatK、线粒体Atp6 和核LFY 基因设计引物,根据各组引物自身的扩增效率,以试剂盒提取的总 DNA为对照,分别对三种细胞器DNA拷贝数的比值进行评估研究,高盐低 pH法提取叶绿体 DNA含量是试剂盒法的 78.38倍,而蔗糖 DNase 法为 15.51倍, 高盐低 pH法是蔗糖 DNase法的 5.05倍。高盐低 pH法提取的叶绿体 DNA产率和含量均优于蔗糖 DNase法,同时在此基础建立了细胞器 DNA含量定量分析方法。随后我们用高盐低 pH法对葱属蔬菜作物的洋葱、大蒜和韭菜进行了测试,获得了预期的效果。该研究为今后葱属作物高效、高纯度、无污染的叶绿体 DNA提取和葱属蔬菜作物细胞器全基因组测序提供依据。

关键词
葱属蔬菜作物;叶绿体 DNA;高盐低pH值法;蔗糖DNase法

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《分子植物育种》印刷版
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