研究报告

基于生物信息学的胶孢炭疽菌效应分子的筛选  

赵美 , 郑文博 , 皮磊 , 周而勋 , 舒灿伟*
华南农业大学农学院, 广东省微生物信号与作物病害防控重点实验室, 广州, 510642
作者    通讯作者
《分子植物育种》印刷版, 2018 年, 第 16 卷, 第 10 篇   
收稿日期: 2018年01月24日    接受日期: 2018年02月06日    发表日期: 2019年01月10日
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摘要

隶属炭疽菌属的胶孢炭疽菌(C. gloeosporioides)是农业和林业生产上重要的病原真菌,可以引起两百多种植物产生病害,对农林业造成严重的经济损失。效应蛋白在胶孢炭疽菌侵染寄主植物的过程发挥了关键作用。为了能筛选出胶孢炭疽菌(Colletotrichum gloeosporioides)的效应蛋白,以便开展对该菌与寄主的互作研究。本研究利用已经发表的胶孢炭疽菌的基因组序列,根据效应蛋白的主要特征,利用一系列生物信息分析服务器(SignalP, TMHMM, Protcomp, big-PI Predictor, TargetP Blast),对该菌的效应蛋白进行预测和分析。我们共分析了胶孢炭疽菌的 15 381 个蛋白质序列,最后获得了 443 个符合效应蛋白特征的候选效应子,其中有 86 个具有预测功能。本研究为阐明炭疽病与植物寄主之间的相互作用提供理论依据。
 

关键词
胶孢炭疽菌;效应蛋白;信号肽;致病机理;寄主互作

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《分子植物育种》印刷版
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