研究报告

基于SSR标记的川西南泡核桃良种DNA指纹图谱构建及聚类分析  

周于波1 , 朱鹏1 , 龚伟1* , 王景燕1 , 闫思宇1 , 吴开志2 , 吴春艳2 , 李海平2 , 龚毅红2 , 段琼2
1 四川农业大学林学院,林业生态工程四川省重点实验室,成都, 611130; 2四川省林木种苗站,成都, 610081
作者    通讯作者
《分子植物育种》印刷版, 2018 年, 第 16 卷, 第 23 篇   
收稿日期: 2018年01月22日    接受日期: 2018年02月23日    发表日期: 2018年12月20日
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摘要

以川西南11个泡核桃优良品种资源为材料,利用 SSR荧光标记技术进行了 DNA指纹图谱构建和遗传关系分析。11对SSR荧光引物在11个泡核桃品种中共检测到59个等位基因,每个 SSR位点有 3~8个等位基因,平均为 5.364个,有较好的多态性。期望杂合度(He)、香农信息指数(I)和多态信息含量(PIC)、变幅分别为 0.579~0.851、 0.993~1.972和 0.490~0.833;均值分别为 0.692、 1.379和 0.642。筛选出 4对 SSR 引物wga004、 wga032、 wga070、 zmz05为核心引物构建了各品种的指纹图谱。聚类分析中, 11个泡核桃品种间遗传相似系数在0.525~0.932之间。说明 11个泡核桃品种间遗传多样性较丰富,亲缘关系与选育的地理来源存在一定的相关性,地域上基因交流广泛,遗传背景复杂。

关键词
SSR标记;泡核桃;指纹图谱;聚类分析

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《分子植物育种》印刷版
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