研究报告

高分辨率熔解曲线技术在大豆基因分型中的应用  

李玉秋1 , 王超越2 , 夏正俊 3 , 刘月4 , 桑永生 4 , 袁翠平1 , 赵洪锟1 , 王玉民1 , 刘晓冬1 , 齐广勋1 , 王英男1 , 董英山1*
1 吉林省农业科学院大豆研究所, 长春, 130033; 2 东北师范大学生命科学院, 长春, 130024; 3 中国科学院东北地理与农业生态研究所, 长春,130102; 4 吉林农业大学生命科学院, 长春, 130118
作者    通讯作者
《分子植物育种》印刷版, 2018 年, 第 16 卷, 第 25 篇   
收稿日期: 2018年01月16日    接受日期: 2018年02月03日    发表日期: 2018年12月28日
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摘要

高分辨熔解曲线(high resolution melting, HRM)分析技术是一种高效,快速,便捷的核苷酸检测方法。本实验从染料用量、模板浓度、产物片段长度 3 个方面探索了适宜 HRM 分析的最佳条件,并利用 HRM技术对单核苷酸(single nucleotide polymorphism, SNP)及插入/缺失(insertion-deletion, InDel)检测及基因分型等方面进行了分析。结果表明:10 L 反应体系中,20Eva Green 饱和染料加入 0.1~0.3 L,模板浓度加入10~200 ng 不影响 HRM 分辨率;扩增产物长度在 70~190 bp 范围内,插入/缺失片段长度 3~13 bp 范围内,高分辨熔解曲线均有较好的分辨效果。利用 HRM 分析技术检测分析 F4 个体基因型,结果与 PAGE 电泳分析完全一致。本实验结果说明,HRM 技术与传统凝胶电泳基因分型方法相比,具有操作简单、分辨率高、准确快速、成本低等优点,是基因型鉴定的最佳选择。

关键词
大豆;高分辨率熔解曲线;基因分型

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《分子植物育种》印刷版
• 第 16 卷
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