研究报告

水稻GATA基因家族生物信息学分析  

骆鹰1 , 王有成2 , 王伟平3 , 张超3*
1 湖南科技学院化学与生物工程学院, 永州, 425199; 2 湖南农业大学农学院, 长沙, 410128; 3 杂交水稻国家重点实验室, 湖南杂交水稻研究中心, 长沙, 410125
作者    通讯作者
《分子植物育种》印刷版, 2018 年, 第 16 卷, 第 2 篇   
收稿日期: 2018年01月09日    接受日期: 2018年02月15日    发表日期: 2018年12月19日
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摘要
GATA 基因家族是生物中一类重要的转录因子,在动植物生长发育、细胞分化以及植物响应环境变化中发挥重要作用。为揭示水稻中 GATA 家族特征及表达模式,利用生物信息学的方法对水稻 GATA 家族进行序列比对分析、保守结构域分析、蛋白三级结构分析以及 GATA 家族表达谱分析。本研究揭示了水稻GATA 家族含有共同的 GATA 结合域,其蛋白三级结构整体相似性较高,组织中的表达水平呈丰富多样性,在激素应激中开启了不同的表达响应模式。这为进一步研究 GATA 基因家族成员的生物学功能提供参考依据,同时为水稻中其他基因家族研究提供指导。
关键词
水稻;保守域;基因表达;生物信息学分析

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《分子植物育种》印刷版
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