安徽农业大学林学与园林学院, 合肥, 230036
作者 通讯作者
《分子植物育种》印刷版, 2018 年, 第 16 卷, 第 14 篇
收稿日期: 2018年01月23日 接受日期: 2018年02月24日 发表日期: 2018年11月12日
作者 通讯作者
《分子植物育种》印刷版, 2018 年, 第 16 卷, 第 14 篇
收稿日期: 2018年01月23日 接受日期: 2018年02月24日 发表日期: 2018年11月12日
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摘要
杨树(Populus L.)是世界上分布最广、适应性最强的树种之一,其天然种众多,长期被作为造林树种广泛应用。物种特有基因的全基因组分析对探明物种在长期进化过程中的适应性进化机制及筛选重要功能性状的基因具有重要意义。本试验通过序列同源性比对的方法,在杨树基因组中鉴定了物种特有基因。在此基础上,统计了杨树特有基因在染色体分布、长度、外显子个数等方面的序列结构特征,并分析了杨树特有基因的功能和扩增机制。与杨树全基因组序列比较后发现,杨树特有基因具有序列长度短、内含子个数少等特点。功能预测的结果表明,杨树特有基因显著富集于翻译和能量代谢的功能中。在进化研究中,鉴定出 91.76%的杨树特有基因在共线性区域中,表明杨树特有基因可能是通过全基因组复制产生的。本研究工作深入挖掘了物种特有基因在序列特征、功能和进化上的规律,为探明杨树适应性进化的分子机制提供理论指导。
关键词
杨树特有基因;鉴定;序列特征;生物功能;适应性进化
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