薛拥志¹ , 王宝地² , 王连荣^3*

1 河北北方学院动物科技学院, 张家口, 075131; 2 河北北方学院理学院, 张家口, 075000; 3 河北北方学院园艺系, 张家口, 075131
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《分子植物育种》印刷版, 2018 年, 第 16 卷, 第 10 篇   
收稿日期: 2017年12月26日    接受日期: 2018年01月23日    发表日期: 2018年08月16日

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推荐引用：

Xue Y.Z., Wang B.D., and Wang L.R., 2018, Analysis of codon bias of PaCBF1 gene in Prunus armeniaca L., Fenzi Zhiwu
Yuzhong (Molecular Plant Breeding), 16(15): 4890-4898 (薛拥志, 王宝地, 王连荣, 2018, 杏扁 PaCBF1 基因密码子偏好性分析 , 分子植物育种, 16(15): 4890-4898)

为了研究杏扁 PaCBF1 基因密码子偏好性，以及为其选择适合的受体，本研究利用 CHIPS、CUSP在线程序以及 CodonW1.4.2 软件对杏扁 PaCBF1 基因密码子偏好性进行分析；利用 SPSS 22.0软件、MEGA5.0软件对各树种 CBF 基因进行聚类分析。结果表明，杏扁 PaCBF1 基因 ENc 值和 CAI 值分别为 54.053、0.163；编码区 G+C 含量高于 A+T 含量，并且偏向于 G/C 结尾的密码子；其他树种 CBF 基因也偏向于 G/C 结尾的密码子。聚类分析表明，杏扁与梅的密码子使用偏性的相似性较高。密码子使用频率比较分析，发现杏扁PaCBF1 基因密码子使用频率与酵母、大肠杆菌、烟草、拟南芥基因组密码子之间存在一定的差异。因此，要使杏扁 PaCBF1 基因在 4 种模式生物中高效表达，需将杏扁 PaCBF1 基因改造成宿主基因组偏爱的密码子。此研究为 PaCBF1 基因选择适合的受体提供了依据，同时也为进一步研究杏扁 PaCBF1 基因的表达、功能以及对非生物逆境的抵抗机制提供理论依据。

杏扁；CBF 基因； 密码子； 偏好性； 聚类分析