1海南大学热带农林学院, 海口, 570100; 2中国热带农业科学院热带作物品质资源研究所, 儋州, 571737
作者
通讯作者
《分子植物育种》印刷版, 2018 年, 第 16 卷, 第 2 篇
收稿日期: 2017年12月21日 接受日期: 2018年04月26日 发表日期: 2018年04月21日
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《分子植物育种》印刷版, 2018 年, 第 16 卷, 第 2 篇
收稿日期: 2017年12月21日 接受日期: 2018年04月26日 发表日期: 2018年04月21日
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摘要
为了研究大薯DaPR基因的表达模式及调控机理,本研究利用逆转录聚合酶链式反应(RT-PCR)技术,从高抗炭疽病大薯材料Da94中获得1个病程相关蛋白1 (pathogensis-related protein 1, PR1)基因,命名为DaPR1。测序显示该基因包含长度为501 bp的完整开放阅读框(ORF),预测编码166个氨基酸。生物信息学分析表明该基因编码的蛋白具有典型SCP-PR1-like保守结构域,Blast比对表明DaPR1蛋白与多种植物的PR1蛋白高度同源。实时荧光定量PCR检测表明,DaPR1基因在高抗种质中受炭疽菌显著诱导,在侵染48 h时其相对表达量达到最大。通过巢式PCR扩增DaPR1上游转录调控序列的5'端,获得1 203 bp的DaPR1基因启动子,序列分析表明该区域除了含有基础的启动子元件CAAT-box和TATA-box外,还存在茉莉酸(JA)、赤霉素(GB)等激素响应元件及真菌诱导响应元件(W-box)。本研究通过克隆和分析DaPR1 基因及其启动子序列,为进一步研究该基因的功能及其表达调控机制奠定了基础。
关键词
大薯;病程相关蛋白1;启动子;基因克隆;生物信息学分析
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