研究报告

小麦NIP蛋白的生物信息学分析  

孙慧1 , 张征宇1 , 王旭2 , 刘娜2 , 石永春2*
1 河南农业大学生命科学学院, 郑州, 450002; 2 河南省实验文博学校, 郑州, 450002
作者    通讯作者
《分子植物育种》印刷版, 2018 年, 第 16 卷, 第 3 篇   
收稿日期: 2017年12月21日    接受日期: 2018年01月29日    发表日期: 2018年12月21日
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摘要

为了探讨小麦 NIP 蛋白的结构特征和性质差异,本研究通过生物信息学手段,鉴定了两条新的小麦 NIP 蛋白,并和两条已知的小麦 NIP 蛋白一起,进行了蛋白质氨基酸序列比对、基序、二级结构、跨膜结构以及亚细胞定位等相关分析。发现两条新的小麦 NIP 蛋白 TaNIP1-2TaNIP4-1,与已知的 TaNIP2-1-LIKETaNIP2-2 一样,均为脂溶性蛋白,且都具有 6 个跨膜结构域、N- 末端和 C- 末端位于膜内等 MIP 蛋白结构共性。亚细胞定位分析结果表明,除 TaNIP4-1 定位于质膜外,其他 3 个小麦 NIP 蛋白均定位于内质网。Motif分析结果显示,除都含有 MIP 基序外,TaNIP1-2 还含有 BCHF 基序和 DUF 2 157 基序。磷酸化位点预测分
析结果显示,
4 个小麦 NIP 蛋白都未预测到磷酸化位点 。本研究可为小麦 NIP
蛋白亚家族的研究和利用提供理论参考及分析依据。
 

关键词
小麦;NIP;MIP;生物信息学

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《分子植物育种》印刷版
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