包昌艳¹ , 邓浪¹ , 周军^1,2* , 王连春^1* , 王大玮¹ , 沈兵琪¹ , 周凡¹ , 夏天帅 ¹

1 西南林业大学西南山地森林保育与利用省部共建教育部重点实验室, 昆明, 650224; 2 北方民族大学生物科学与工程学院, 银川, 750021
作者    通讯作者
《分子植物育种》印刷版, 2018 年, 第 16 卷, 第 1 篇   
收稿日期: 2017年11月20日    接受日期: 2017年12月14日    发表日期: 2018年08月01日

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推荐引用：

引用格式：Bao C.Y., Deng L., Zhou J., Wang L.C., Wang D.W., Shen B.Q., Zhou F., and Xia T.S., 2018, Genome-wide identification and analysis of WRKY transcription factor family in kiwifruit, Fenzi Zhiwu Yuzhong (Molecular Plant Breeding), 16(14): 4473-4488 (包昌艳, 邓浪, 周军, 王连春, 王大玮, 沈兵琪, 周凡, 夏天帅, 2018, 猕猴桃 WRKY 转录因子家族全基因组鉴定与分析, 分子植物育种, 16(14): 4473-4488)  

本研究旨在鉴定猕猴桃 WRKY 基因家族成员，为进一步研究 AcWRKY 转因子在猕猴桃生长和发育进程及生物和非生物胁迫中的调控作用提供信息。利用‘红阳’猕猴桃全基因组数据，通过生物信息学在线分析网站与软件利用的方法，对猕猴桃 WRKY 转录因子家族成员进行鉴定和系统分析。分析表明：从猕猴桃全基因组中共鉴定出 89 个 A cWRKY 基因，分组鉴定和进化分析显示，AcWRKY 蛋白可分为玉、域和芋个类型。玉组共有 19 个成员，其锌指结构是 CX4CX22-23HXH (C2H2 类型)；域组共有 61 个成员，进一步分为域a、域b、域c、域d 和域e 共 5 个亚组，分别有 4、7、27、11 和 12 个成员，其锌指结构为 CX4-5CX23HXH (C2H2 类型)；芋组有 9 个成员，其锌指结为 CX7CX23-24HXC (C2HC 类型)；AcWRKY 蛋白序列比对及保守基序分析表明，AcWRKY 结构域高度保守，但也存在一定的变异。染色体定位表明 A cWRKY 基因不均匀分布于除 9 号染色体外的 28 条染色体上，有 11 个 WRKY 基因无法定位到染色体上，同时发现部分基因存在串联复制现象。同源拟南芥不同组织的基因表达模式分析表明，33 个 WRKY 基因在植物根、叶、花和果四个器官中均有显著性表达，但相对表达水平存在差异。猕猴桃 WRKY 基因家族具有丰富的生物学功能，与其它已报道的物种WRKY 基因相似，广泛参与植物营养和生殖生长以及环境胁迫等多方面的调控。

猕猴桃；WRKY 转录因子；全基因鉴定； 生物信息学分析