胡利宗^1,2 , 王俊生 ¹ , 刘红占¹ , 赵锦慧¹ , 王秋霞¹ , 纪秀娥^1*

1 周口师范学院, 生命科学与农学学院, 周口, 466001; 2 周口师范学院, 河南省作物分子育种与生物反应器重点实验室, 周口, 466001
作者    通讯作者
《分子植物育种》印刷版, 2018 年, 第 16 卷, 第 2 篇   
收稿日期: 2017年11月17日    接受日期: 2017年12月08日    发表日期: 2018年08月02日

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SBP 蛋白是植物特有转录因子，参与众多生物学过程。尽管在许多植物中 SBP 家族基因已经被鉴定，但在菜豆中仍然未见报道。本研究为探索菜豆 SBP-box 基因家族，基于生物信息学手段充分挖掘菜豆基因组和转录组数据资源，鉴定出 23 个菜豆 SBP 基因，并系统分析了这些 SBP 基因的结构、定位、保守基序、表达和系统进化关系。结果表明：23 个基因被分为 2 个大类群，散落分布在 10 条染色体上；菜豆、拟南芥和水稻 SBP 蛋白共存在 16 种类型保守基序组成类型；菜豆 SBP 基因结构种类有 5 种，其外显子数目分别为2、3、4、9 和 10 个；基于 RNA-seq 测序数据的表达分析表明菜豆 SBP 基因表达具有高度多样化特征，这说明参与许多生物学过程。本研究为菜豆 SBP 基因功能研究提供重要线索。

菜豆；基因家族；SBP 基因；转录因子