研究报告

辣木 SCoT-PCR 反应体系建立和引物筛选  

林艺华 , 郑涛 , 蔡坤秀 , 林宗铿*
福建省热带作物科学研究所, 漳州, 363000
作者    通讯作者
《分子植物育种》印刷版, 2018 年, 第 16 卷, 第 28 篇   
收稿日期: 2017年11月06日    接受日期: 2017年12月06日    发表日期: 2018年07月18日
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摘要

SCoT-PCR 是一种单引物扩增分子标记方法,具有丰富的多态性,低廉的成本和较好的引物通用性,已在多种植物上加以应用。本研究采用 L16(45)正交试验设计,对 SCoT-PCR 的影响因素进行优化试验,建立了适用于辣木的最佳 SCoT-PCR 反应体系,并对 40 SCoT 引物进行筛选。结果表明,25 L 最佳反应总体积包含 2.0 mmol/L Mg2+0.3 mmol/L dNTPs1.5U ExTaq1.25 mol/L 引物,50 ng DNA 模板,其中,dNTPs对该体系的影响程度最大。此外,40 SCoT 引物共筛选出 15 条多态性好且适合辣木扩增的引物。该体系的建立为今后利用 SCoT 分子标记分析辣木种质资源鉴定与多样性、构建指纹图谱和辅助选择育种提供新的技术手段。

关键词
辣木;SCoT;反应体系;引物筛选

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《分子植物育种》印刷版
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