马玉申¹ , 刘泽航 ¹ , 揭雨成^1,2* , 邢虎成^1,2*

1 湖南农业大学苎麻研究所, 长沙, 410128; 2 湖南省种质资源创新与资源利用重点实验室, 长沙, 410128
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《分子植物育种》印刷版, 2018 年, 第 16 卷, 第 10 篇   
收稿日期: 2017年11月06日    接受日期: 2017年12月06日    发表日期: 2018年07月12日

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甘露聚糖酶基因在植物种子萌发、果实的成熟软化、植物器官的脱落以及非生物胁迫等过程发挥重要作用。为研究其在苎麻中的基因功能，本研究根据苎麻转录组测序中的 BnMAN1 片段序列，克隆该基因的cDNA 全长及其上游的调控序列。生物信息学分析发现：BnMAN1 基因上游的调控序列包括 TATA-box、CAAT-box、AE-box、Box 4、I-box、GAG-motif、GATAmotif、Skn1_motif、ARE、AuxRR-core、TCA-element、MBS 等顺式作用元件。BnMAN1 基因开放阅读框为 1 128 bp，编码 375 个氨基酸，预测其相对分子质量为42.47 kD，理论等电点为 9.45。与树(ABV32548)、苦瓜(XP_022132624)、毛果杨(XP_006383170)、野生大豆(KHN36084)、橡胶树(XP_021678603)氨基酸序列相似性分别为82%、81%、79%、79%、76%。蛋白的二级结构中 琢- 螺旋约占 45.33%，延伸链约为 15.20%，无规则卷曲约为 39.47%。结构域分析发现具有COG3934、Cellulase 结构域，属于 茁- 甘露聚糖酶类。苎麻 BnMAN1 及其启动子将为今后对该基因在苎麻中的功能研究提供帮助。

苎麻；茁- 甘露聚糖酶；BnMAN1；启动子；生物信息学分析