研究报告/Research Report

甜瓜 SSR 标记在葫芦科不同作物间的通用性分析  

宋金亮 , 杨路明 , 郭禄芹 , 朱华玉 , 朱磊 , 胡建斌 , 孙守如
河南农业大学, 园艺学院, 郑州, 450002
作者    通讯作者
《分子植物育种》印刷版, 2018 年, 第 16 卷, 第 25 篇   
收稿日期: 2017年10月30日    接受日期: 2017年11月29日    发表日期: 2018年08月01日
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推荐引用:

Song J.L., Yang L.M., Guo L.Q., Zhu H.Y., Zhu L., Hu J.B., and Sun S.R., 2018, Generality analysis of melon SSR markers
in different cucurbit crops, Fenzi Zhiwu Yuzhong (Molecular Plant Breeding), 16(12): 3980-3988 (
宋金亮, 杨路明, 郭禄芹, 朱华玉朱磊, 胡建斌, 孙守如, 2018, 甜瓜 SSR 标记在葫芦科不同作物间的通用性分析, 分子植物育种, 16(12): 3980-3988)

摘要

微卫星标记(SSR)在近缘物种间具有通用性,因其高效率、低成本可广泛用于跨物种间的遗传多样性分析、基因定位和图谱构建等。本试验基于甜瓜基因组测序结果开发了 120 SSR 标记,研究其在 8 种葫芦科作物间的通用性及作物内的多态性,并利用 NTSYS 软件分析 37 份不同瓜类作物材料间的遗传多样性。结果显示,114 对标记均在甜瓜基因组中得到有效扩增,黄瓜中有 108 对标记有效扩增,通用性比率为94.7%,南瓜中能有效扩增标记最少,其通用性比率也达到了 41.2%,在 8 种葫芦科作物间均通用的标记有29 对;通过对通用性标记的多态性分析表明,甜瓜多态性比率最高为 61.4%,西瓜、黄瓜、苦瓜、冬瓜、西葫芦、南瓜和丝瓜多态性比率分别为 32.5%14%4.4%8.8%3.5%13.2%11.4%;不同作物间的平均遗传相似系数在 0.70~0.83 之间,其中甜瓜和黄瓜平均遗传相似系数较小,亲缘关系较近,西葫芦和南瓜间的平均遗传相似系数最小,亲缘关系最近。这些通用性标记将有利于提高葫芦科作物整体分子生物学研究水平。

关键词
甜瓜;葫芦科;SSR;通用性;遗传多样性

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《分子植物育种》印刷版
• 第 16 卷
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