研究报告/Research Report

蔗茅野生种响应低温胁迫的数字基因表达谱  

孟玉 , 陈疏影 , 徐荣 , 曹哲群 , 刘鲁峰 , 王先宏 , 何丽莲* , 李富生*
云南农业大学农学与生物技术学院, 昆明, 650201
作者    通讯作者
《分子植物育种》印刷版, 2018 年, 第 16 卷, 第 12 篇   
收稿日期: 2017年10月30日    接受日期: 2017年12月20日    发表日期: 2018年08月01日
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推荐引用:

Meng Y., Chen S.Y., Xu R., Cao Z.Q., Liu L.F., Wang X.H., He L.L., and Li F.S., 2018, Digital gene expression profiles of
wild species of
Erianthus fulvus response to low temperature stress, Fenzi Zhiwu Yuzhong (Molecular Plant Breeding), 16(12): 3877-3886(孟玉, 陈疏影, 徐荣, 曹哲群, 刘鲁峰, 王先宏, 何丽莲, 李富生, 2018, 蔗茅野生种响应低温胁迫的数字基因表达谱, 分子植物育种, 16(12): 3877-3886)

摘要

以蔗茅野生种(昆明蔗茅 99-1)为材料,利用数字基因表达谱(DGE)技术,对 4低温胁迫处理后的蔗茅野生种构建的 cDNA 文库进行差异基因表达谱分析。结果表明,低温处理 24 h (ER-LT1)2 391 个基因,低温处理 72 h (ER-LT2)4 892 个基因因低温处理而发生表达变化。GO 功能显著性富集分析表明,差异基因主要涉及对非生物刺激反应、氧化还原过程、能量代谢以及催化活性。KEGG 富集分析表明,两个不同处理时间下共同富集的通路主要为植物激素信号转导途径、植物 - 病原体互作通路、光合作用通路、淀粉和蔗糖代谢途径和苯丙烷生物合成途径等。利用实时荧光定量 PCR (qRT-PCR)验证 2 个在低温胁迫条件下的差异表达基因,其结果与 DGE 分析结果基本一致,证实了 DGE 测序结果的可靠性。

关键词
蔗茅; 低温胁迫; 数字基因表达谱; 差异基因

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《分子植物育种》印刷版
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