研究报告/Research Report

12个辣椒microRNA的靶标预测及表达分析  

孟纯阳1,2 , 魏小春1 , 赵艳艳1 , 原玉香1 , 王志勇1 , 张晓伟1* , 郑直1 , 姚秋菊1 , 张强1
1 河南省农业科学院园艺研究所, 郑州, 450002; 2 郑州大学生命科学学院生物工程系, 郑州, 4500001
作者    通讯作者
《分子植物育种》印刷版, 2018 年, 第 16 卷, 第 5 篇   
收稿日期: 2017年10月20日    接受日期: 2017年11月19日    发表日期: 2018年08月01日
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推荐引用:

Meng C.Y., Wei X.C., Zhao Y.Y., Yuan Y.X., Yang S.J., Wang Z.Y., Zhang X.W., Zheng Z., Yao Q.J., and Zhang Q.,
2018, Targets prediction and expression analysis of 12 microRNAs in pepper, Fenzi Zhiwu Yuzhong (Molecular Plant Breeding), 16(12): 3820-3829 (
孟纯阳, 魏小春, 赵艳艳, 原玉香, 杨双娟, 王志勇, 张晓伟, 郑直, 姚秋菊, 张强, 2018, 12 个辣椒 microRNA 的靶标预测及表达分析, 分子植物育种, 16(12): 3820-3829)

摘要

为了探索 12 个辣椒 microRNA 的时空表达及胁迫响应。根据辣椒中已鉴定和注释的 microRNA
息,进行靶标预测和时空表达分析。靶标除转录因子外,还有
ABC transporterWD40 和锌指结构等。辣椒中miRNA 表达具有组织特异性,并且 miRNA 在果实发育中也起作用。同时,对辣椒进行脱落酸、茉莉酸甲酯、高温、低温、盐和辣椒疫病病原菌处理。采用实时荧光定量 PCR 检测 12 miRNA 在不同处理下的表达情况。结果发现 microRNA 对胁迫有响应,对胁迫呈现出显著性表达差异,miR4414b 受疫病胁迫上调表达,miR167 在脱落酸胁迫下下调表达,miR396d 经脱落酸、茉莉酸甲酯和疫病诱导后,显著上调表达。miR156 在高温和低温胁迫下下调,靶标转录因子 SBP 可能上调,适应胁迫反应。但 miR156a NaCl 诱导后显著上调表达,可能导致靶标下调表达。miR171c 经脱落酸、茉莉酸甲酯和疫病处理显著下调,靶标 GRAS 基因可能上调抵抗胁迫,本研究对辣椒中 miRNA 的进一步研究提供帮助。

关键词
辣椒; microRNA; 靶标; 胁迫; 表达分析

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《分子植物育种》印刷版
• 第 16 卷
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