研究报告

不同类型烟草亲本及其杂交组合转录组分析  

谢瑞1,2 , 张启发1,2 , 刘云鹤1,2 , 聂琼1,2*
1 贵州大学农学院, 贵阳, 550025; 2 贵州省烟草品质研究重点实验室, 贵州大学烟草科学研究中心, 贵阳, 550025
作者    通讯作者
《分子植物育种》印刷版, 2018 年, 第 16 卷, 第 9 篇   
收稿日期: 2017年10月16日    接受日期: 2018年04月18日    发表日期: 2019年01月21日
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摘要

本研究以烟草品种 VA116、巴斯玛以及它们的杂种一代 VA116巴斯玛为研究材料,通过高通量Illumina HiseqTM 测序,对获得的转录组数据进行生物信息学分析,为研究烟草重要性状杂种优势的形成提供基础数据。结果表明,3 个转录本中约有 1/3 的基因处于不表达状态,中、低度表达基因比例较高,约占 53%,高度表达基因最少;杂交组合与其母本间找到差异表达基因 406 个,其中,上调基因 334 个,下调基因 72 个;与父本巴斯玛间找到 1 932 个差异表达基因,上调基因 1 360 个,下调基因 572 个;差异基因 GO 富集分析显示,富集最显著的 20 GO terms 中有 75%注释到生物学过程,20%与分子功能有关,仅 5%富集到细胞组分;KEGG pathway 富集分析表明,这些差异基因显著富集在与光合作用相关的通路中,如卟啉与叶绿素代谢、光合作用 - 天线蛋白和光合生物固碳;旺长期杂种一代在株高、色素含量和叶面积大小等性状方面表现出较强的优势,推测亲、子代间的这些差异表达基因可能与烟草相关性状杂种优势的形成有关。

关键词
烟草;杂种优势;转录组测序

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《分子植物育种》印刷版
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