研究报告

拟南芥和禾本科植物 ABP1 家族分析  

张聪* , 赵康路* , 胡静静 , 孟文静 , 孙长凯 , 马岚 , 王振怡*
华北理工大学生命科学学院, 基因组学与计算生物学研究中心, 唐山, 063210
作者    通讯作者
《分子植物育种》印刷版, 2018 年, 第 16 卷, 第 11 篇   
收稿日期: 2017年10月04日    接受日期: 2017年11月04日    发表日期: 2018年06月22日
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摘要

生长素是植物中非常重要的调控激素,ABP1 在很多生长素的调控作用中都起到关键作用,研究证明生长素结合蛋白与信号转导有关,但其具体转导路径还不清楚,本研究以已知拟南芥生长素结合蛋白(ABP1)为模板,在禾本科二穗短柄草、大麦、水稻、高粱、谷子和玉米 6 个物种中鉴定出 10 ABP1 蛋白。通过序列保守性分析,我们了解到这些蛋白在 C 端均有一个保守结构域和典型的保守基序 Motif2Motif3,并且对其进行选择压力分析只得到 1 个氨基酸位点受到显著正选择。有趣的是水稻 Os12g34460 基因十分特殊,它在进化树中发生显著分歧且丢失了 C 端的保守结构域,在亚细胞定位中也是有别于其它所有蛋白。最后,我们以玉米为代表进行蛋白互作分析,发现 ABP1 ABP4 ABP5 存在密切的关系。本研究使以 ABP1为代表的生长素结合蛋白相关性质更加具体清晰,为揭示其作为重要信号的具体传导机制提供参考。

关键词
ABP1;禾本科;保守性分析;互作;进化分析

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《分子植物育种》印刷版
• 第 16 卷
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