杨春霞^* , 李康琴 , 丁伟 , 郑永杰

江西省林业科学院, 南昌, 330013
作者    通讯作者
《分子植物育种》印刷版, 2018 年, 第 16 卷, 第 10 篇   
收稿日期: 2017年08月01日    接受日期: 2017年08月25日    发表日期: 2018年06月21日

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以南酸枣雌株叶片和成熟果实为材料，采用Illumina HiSeq^TM 4000测序平台进行转录组测序，共获得14.15G有效数据，通过序列拼接组装得到46 936条Unigene，平均长度为1 287 bp。36 299条Unigene（77.33%）在7大数据库（NR, NT, KO, Swiss-Prot, PFAM, GO和KOG）中得到注释，其中与GO数据库比对上的26 014条Unigene可分为生物过程、细胞组分和分子功能3大类53分支，注释到KOG数据库中的8 459条Unigene依据功能可分为25类。与KEGG数据库比对，6 225条Unigene分属5大类246条代谢通路中。南酸枣叶片和果实转录组中共发现5 631个差异表达基因，包括1 930个上调基因和3 701个下调基因。本研究获得的转录组数据极大地扩充了南酸枣基因资源，将有助于开展南酸枣功能基因挖掘与利用、分子辅助育种及其种质资源遗传改良等方面的研究。

南酸枣；转录组；高通量测序；基因注释