研究报告/Research Report

小麦条锈菌看家基因SNP引物的开发及多态性位点研究  

李明菊1* , Md. Ashraful Alam1,2 , 李昊星3 , 程加省4 , 丁明亮4
1云南省农业科学院农业环境资源研究所, 昆明, 650205;
2孟加拉国农业研究所小麦研究中心, 迪纳杰布尔, 5200, 孟加拉国;
3华中农业大学生命科学技术学院, 武汉, 430070;
4云南省农业科学院粮食作物研究所, 昆明, 650205
作者    通讯作者
《分子植物育种》印刷版, 2018 年, 第 16 卷, 第 23 篇   
收稿日期: 2017年07月17日    接受日期: 2017年08月06日    发表日期: 2018年04月01日
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摘要

利用NCBI数据库进行小麦条锈菌看家基因SNP引物开发,从NCBI搜索到15个基因的序列,利用Primer Premier 5.0软件设计了22对引物,利用其进行条锈菌DNA 的PCR扩增、测序,并与标准序列比对,从而筛选出SNP引物。在候选基因中,柠檬酸盐合酶(Cs热休克蛋白hsp90(Hsp泛素活化酶E1(Uba)及泛素结合酶E2(Ubc)4个基因的5对SNP引物表现多态性,能检测到条锈菌SNP位点依次为4、6-7、4和7个,均为系统发生信息位点。并摸索出优化的PCR反应体系及条件。利用开发的引物研究条锈菌群体结构,可揭示病原菌起源、进化、传播,为病害治理提供依据。

关键词
小麦条锈菌;看家基因;单核苷酸序列多态性;引物开发

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《分子植物育种》印刷版
• 第 16 卷
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