研究报告

山杏LACS基因家族生物信息学及表达分析  

邓舒雅 , 肖羽 , 张鹤婷 , 陈惠萍 , 钮俊*
海南大学热带农林学院, 海口, 570100
作者    通讯作者
《分子植物育种》印刷版, 2018 年, 第 16 卷, 第 32 篇   
收稿日期: 2017年08月28日    接受日期: 2017年09月28日    发表日期: 2018年04月21日
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摘要

在植物脂肪酸的代谢途径中,长链酰基辅酶A合成酶把游离脂肪酸活化成酰基辅酶A,是调控脂肪酸代谢的重要酶依据山杏(Prunus sibirica)转录组数据,开展LACS保守域比对分析,共确定6个具有完整ORFLACS基因,其长度为2 360 bp-2 900 bp编码氨基酸为654-730 aa。开展LACS蛋白保守域及进化树分析,确定了山杏LACS具有AMP绑定域,说明其在物种间的高度保守性。同时,不同发育期山杏杏仁LACS基因开展qRT-PCR表达谱分析为探究杏仁发育过程中油脂的累积模式以山杏为试材,采用索氏提取法对其油脂含量进行测定确定杏仁油的主要累积期在20-50 DAF结合油脂含量的检测结果,对蛋白互作网络和基因表达等方面加以分析,确定山杏LACS9与油脂累积密切相关。本研究结果可为后续探究LACS基因家族在山杏杏仁发育及油脂累积中的调控机制奠定基础。

关键词
山杏;长链酰基辅酶A合成酶;生物信息学分析;qRT-PCR分析

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《分子植物育种》印刷版
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