研究报告/ Research Report

菊芋实时定量PCR分析中内参基因的选择  

宋向阳1 , 杨世鹏1 , 钟启文1, 2 , 王丽慧1 , 赵孟良1 , 李莉1, 2 , 孙雪梅1, 2
1青海大学农林科学院青海省蔬菜遗传与生理重点实验室, 西宁, 810016;
2青海大学三江源生态和高原农牧业国家重点实验室, 西宁, 810016
作者    通讯作者
《分子植物育种》印刷版, 2018 年, 第 16 卷, 第 28 篇   
收稿日期: 2017年06月22日    接受日期: 2017年07月15日    发表日期: 2017年08月08日
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摘要

        实时荧光定量PCR具有灵敏度、特异性和重复性好等优点,是植物中常用于基因表达和转录分析的重要手段。在分子生物学的研究中,选择表达相对稳定的内参基因是分析实时荧光定量实验数据的前提。本研究以菊芋(Helianthus Tuberosus)开花时期的幼根、嫩茎、叶片、块茎和花瓣为材料,运用荧光定量PCR方法分析了18S rRNA、EF1α、Actin、β-actin、GAPDH、25S rRNA和UBQ5 7个内参基因的表达量,通过GeNorm、NormFinder和Bestkeeper软件的综合分析,发现25S rRNA的稳定性最好,可用于菊芋基因表达的内参基因。而GAPDH在不同样品中稳定性最差,不适合作为内参基因。本研究为菊芋实时荧光定量PCR中内参基因的选择提供了参考。

关键词
菊芋;实时荧光定量PCR; 内参基因

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《分子植物育种》印刷版
• 第 16 卷
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