研究报告

基于DNA测序技术对基因组DNA混合池在SSR引物筛选中的可靠性研究  

刘果1* , 谢耀坚1 , 陈鸿鹏1 , 吴志华1 , 张党权2
作者    通讯作者
《分子植物育种》印刷版, 2018 年, 第 16 卷, 第 41 篇   
收稿日期: 2017年05月27日    接受日期: 2017年07月15日    发表日期: 2018年02月28日
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摘要

SSR-PCR产物的重测序是SSR标记技术开发和应用的必要步骤。本研究以6个桉树DNA样品为对照组,1个基因组DNA混合池为试验组进行基因组DNA混合池在SSR引物筛选中的可靠性性分析。通过SSR-PCR产物的重测序分析,6个桉树单一DNA样品与基因组DNA混合池的扩增序列比对结果分析显示,两种模板扩增结果差异不显著,即基因组DNA混合池可以替代多个单一DNA样品进行SSR引物的高效筛选。利用20对SSR引物在6种桉树DNA样品中的扩增序列进行多态性分析发现,同一位点不同桉树种间的扩增序列存在长度多态性和核苷酸多态性,从而证实了SSR序列的多态性和复杂性,为SSR标记技术在桉树遗传育种研究中的应用提供了理论依据。

关键词
基因组DNA混合池; SSR; DNA测序; 桉树

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《分子植物育种》印刷版
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