1广东农工商职业技术学院,广州, 510507; 2华南农业大学林学与风景园林学院,广州, 510642; 3广东农垦热带农业研究院,广东省湛江农垦科学研究所,湛江, 524086; 4仲恺农业工程学院农业与生物学院,广州, 510225
作者 通讯作者
《分子植物育种》印刷版, 2021 年, 第 19卷, 第 40 篇
收稿日期: 2021年05月23日 接受日期: 2021年05月31日 发表日期: 2021年12月14日
作者 通讯作者
《分子植物育种》印刷版, 2021 年, 第 19卷, 第 40 篇
收稿日期: 2021年05月23日 接受日期: 2021年05月31日 发表日期: 2021年12月14日
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摘 要
剑麻是重要的国防和工业战略物资,准确和快速鉴别剑麻种质对于剑麻品种选育具有重要意义。本研究对 82份剑麻种质资源中的rbcL 和matK 的 DNA条形码编码区进行测序,分析了rbcL 和matK 的 NJ聚类图、条形码序列多样性以及碱基替换概率。结果显示,rbcL 序列 GC含量为 42.97%,matK 序列 GC含量为30.55%;matK DNA条形码差异位点数和位点变异率明显高于rbcL DNA;NJ聚类图显示,rbcL 序列可将 82个剑麻种质分为 6个亚群,而matK 序列可将 82个剑麻种质分为 8个亚群,群内每种剑麻种质与其他种质之间均存在一定的遗传距离;差异位点数、位点变异率、核苷酸多样性、中性检验统计等序列多样性结果表明,matK 序列的差异性明显高于rbcL 序列;rbcL 序列和matK 序列的碱基发生了不同程度的转换和颠换,碱基转换主要发生在 T与 C之间,而 C和 G碱基之间比较保守,发生的颠换概率最低。综上所述,matK 序列在剑麻种质中遗传多样性更高,更适用于剑麻种质鉴别。
关键词
剑麻;遗传多样性;DNA条形码;matK 基因;rbcL 基因