刘晓慧^1,2 , 张爱冬¹ , 尚静^1,2 , 朱宗文¹ , 谭枫¹ , 王勇³ , 姜俊³ , 李烨⁴ , 查丁石¹ , 吴雪霞^1*

1 上海市农业科学院园艺研究所, 上海, 201403; 2 上海海洋大学, 上海, 201306; 3 驻马店市农业科学院园艺研究所, 驻马店, 463000; 4 哈尔滨市农业科学院, 哈尔滨, 150070
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《分子植物育种》印刷版, 2022 年, 第 20卷, 第 16 篇   
收稿日期: 2020年12月03日    接受日期: 2020年12月11日    发表日期: 2023年04月18日

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为了在基因组水平上揭示青皮茄子材料的遗传多样性，发掘重要种质特性基因，本研究采用RAD-seq 测序鉴定了国内外 49 份青皮茄子材料的 SNP 标记，计算观察杂合度(Ho)、核苷酸多样度(π)、近交系数(Fis)、遗传分化系数(Fst)等遗传统计量指标，分析其遗传多样性和群体结构，并通过选择信号检测鉴定受选择基因。结果表明，在 49 份青皮茄子材料中鉴定 SNP 标记 77 431 个，遗传聚类分析将 49 份青皮茄子材料分为 4 个群体，POP4 和 POP2 的遗传多样性最为丰富，POP1 的遗传多样性相对匮乏；POP4 和 POP2 的近交系数 Fis 最高，并且群体结构分析结果显示最优分群数为 4，类群之间存在相互交叉现象，说明每个类群间有很近的亲缘关系。通过选择信号分析，在 49 个青皮茄子群体中检测出 10 个区域受到选择作用，包含 144个受选择基因。进一步对这些受选择基因进行了 GO 富集分析，在分子功能(Molecular function)、细胞组份(Cellular component)和生物学过程(Biological process)均存在选择性富集。

青皮茄子；RAD-seq；遗传多样性；群体结构