华中农业大学植物科学技术学院,武汉, 430070
作者 通讯作者
《分子植物育种》印刷版, 2021 年, 第 19卷, 第 4 篇
收稿日期: 2019年12月07日 接受日期: 2019年12月10日 发表日期: 2021年04月19日
作者 通讯作者
《分子植物育种》印刷版, 2021 年, 第 19卷, 第 4 篇
收稿日期: 2019年12月07日 接受日期: 2019年12月10日 发表日期: 2021年04月19日
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摘 要
为进一步对大豆中的miR482家族有更全面的了解,以大豆miR482家族为研究对象,利用多种数据库、预测网站以及分析软件对大豆中miR482家族的前体及成熟序列的特征、靶基因预测及其表达模式分析。在通过miRBase搜索得到的9条gma-miR482家族成熟序列中,除gma-miR482b/e均位于chr20以外,其余序列均位于不同染色体。gma-miR482家族成熟序列核心区域具有较高的保守性。进一步的分析共预测到24个gma-miR482的候选靶基因,其中大部分属于NBS-LRR家族(nucleotide binding site leucine-rich repeats)。靶基因表达模式分析表明gma-miR482可能在大豆的不同发育时期发挥作用。相关数据为深入解析大豆miR482家族的功能及分子调控机制提供了支持。
关键词
大豆; gma-miR482;生物信息学分析;靶基因