张博 , 李燕玲 , 张金兰 , 黄东益 , 吴文嫱 , 许云 , 黄小龙 , 夏薇

海南大学热带农林学院,海口, 570100
作者    通讯作者
《分子植物育种》印刷版, 2019 年, 第 17卷, 第 2 篇   
收稿日期: 2018年10月23日    接受日期: 2018年11月26日    发表日期: 2019年05月23日

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参薯(Dioscorea alata)，其地下块茎富含淀粉、多糖、蛋白质等多种营养物质，是热带和亚热带地区重要的主食之一，同时也是药物和生物质能源的原料。由于可获得的序列非常有限，参薯分子水平研究非常薄弱。在本研究中，我们以现有的参薯基因组序列和表达序列为基础，使用生物信息学的方法，挖掘参薯序列中的 microRNA 基因，并对这些基因的表达特征进行分析。根据 miRBase数据库中公布的成熟miRNA序列和参薯基因组，预测属于参薯 miR159、 miR164、 miR167和 miR168家族的miRNA基因 13个。于此同时，我们根据参薯的表达序列，预测了这些家族的靶基因共 17 个，并对靶基因进行了功能注释。之后，我们使用RT-PCR检测 13个 miRNA在参薯叶片、缠绕茎、块茎等多个组织的表达，找到了 5个 miRNA基因在块茎中表达，有可能块茎发育相关。本研究为进一步探索 miRNA在参薯块茎发育中的功能，为构建 miRNA调控块茎发育网络提供信息，为改良参薯薯型提供帮助。

参薯(Dioscorea alata)；microRNA；靶基因；基因表达