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PNAS发表重要水稻研究成果

2016年8月17日,国际著名学术期刊《美国国家科学院院刊》杂志在线发表了华中农业大学生命科学技术学院张启发教授和美国亚利桑那大学Rod A. Wing教授合作题为《Extensive sequence divergence between the referencegenomes of two elite indica ricevarieties Zhenshan 97 and Minghui 63》的研究论文,研究发布了两个籼稻品种的参考基因组序列。

该研究选用了两个我国杂交稻育种的核心亲本品种:珍汕97和明恢63。基于传统的BAC连BAC策略构建物理图谱,采用最新的PacBio单分子实时测序的第三代测序技术(读段长、通量高),以二代序列作补充组装,得到的珍汕97基因组序列346.9 Mb,分布在237重叠群,基因组覆盖率90.6%;明恢63基因组359.9 Mb,由181重叠群构成,覆盖率93.2%。两个基因组序列的准确率均在99.99%以上,是迄今为止公布的最高质量的作物基因组序列。

比较分析这两个籼稻参考基因组,研究人员发现它们间存在大量的序列结构差异,尤其是倒位、易位、有/无等形式的变异和片段复制。绘制了籼粳稻之间以及籼稻不同亚群间基因组的共线性区域和特有区域,并详细分析了这些变异对基因的影响。这些分析表明水稻研究中拥有多个参考基因组是十分必要的。这两个籼稻基因组的发布,为全球水稻尤其是籼稻的研究提供了两份高质量参考基因组,填补了该领域的空白。为进一步在分子水平阐明杂种优势的生物学机理,提高杂种优势利用水平奠定了坚实基础,为水稻产量、品质、抗病等性状的功能基因组的研究和育种应用提供了新的机遇。

 

文章链接:http://www.pnas.org/content/early/2016/08/16/1611012113.abstract

 

日期:2016-08-26    来源:生物帮    

网址:http://www.bio1000.com/periodical/pnas/506279.html